2008年12月28日 星期日

德國Museum Wiesbaden館藏重整

Museum Wiesbaden位於德國Wiesbaden, 為德國各聯邦的邦立博物館規模較小, 且因財政問題一直未能妥善管理的一個自然史博物館. 此博物館創建於1829年, 其鱗翅目館藏中具有Esper, Pagenstecher以及Bastelberger之模式標本, 深具 學術價值. 近兩年來此博物館在慕尼黑博物館以及斯圖加特博物館的協助下重新整頓館藏並設立網頁對外開放. 其官方網頁於.

2008年12月17日 星期三

有關發表年代的括號型式問題

在國際動物命名規約中, 圓括號與方括號代表的意義是不同的. 圓括號有兩個意涵, 若出現在屬名之後, 如A-us (B-us), 那麼B-us代表的亞屬名. 那麼圓括號所代表的是亞屬名. 若圓括號出現的位置在於作者與年代處, 那就表示該種曾經在屬級歸屬方面被轉移過. 方括號的使用場合乃是對跨年份或是發表年代不確定的情況進行標記. 以A-us b-us Who, 1999 [2000]來說, 這表示實際的發表年代是2000年. 然而這是ICZN第三版及之前的使用方法.

ICZN第四版的第22號條款對這樣的情況有了新的規定. 摘錄如下:

Article 22. Citation of date. When cited, the date of publication of a name follows the name of the author (see Article 51).

Recommendation 22A. Citation.

22A.1. Citation of date. It is strongly recommended that the date of publication (and the authorship; see Article 50) of a name be cited at least once in a work which deals with a taxon. This is particularly important for homonyms and for species-group names not in their original combinations.

22A.2. Method of citation. In citing the date of publication of a name, an author

22A.2.1. should not interpose more than a comma between the name of the author and the date;

22A.2.2. if the actual date of publication is different from the date specified in the work (imprint date), should cite the actual date of publication; except that

22A.2.3. if wishing to cite both the actual and the imprint dates, should first cite the actual date (cited as above), followed by the imprint date for information and enclosed in parentheses or other brackets and quotation marks; for a different use of parentheses for the dates of family-group replacement names maintained under Article 40.2.1, see Recommendation 40A.

Examples. Ctenotus alacer Storr, 1970 ("1969"), or Ctenotus alacer Storr, 1970 ["1969"], or Ctenotus alacer Storr, 1970 (imprint 1969), or Ctenotus alacer Storr, 1970 (not 1969), was established in a work which, although published in 1970, carried an imprint date of 1969; Anomalopus truncatus (Peters, 1876 ["1877"]) was established in a different genus from Anomalopus in a work which, although published in 1876, carried an imprint date of 1877.

22A.3. Date in a changed combination. When the original date of publication of a species-group name is cited with the name in a changed combination, the date should be enclosed within the same parentheses as the name of the original author [Art. 51.3].

Example. Limax ater Linnaeus, 1758 should be cited as Arion ater (Linnaeus, 1758) when the species is included in the genus Arion.

對資料庫設計者來說, 括號使用方式的改變會直接影響到欄位的設計, 對資料的判別以及呈現的方式. Digileps計畫將在2009年內根據新的法規針對這個問題進行調整.

2008年12月16日 星期二

Digileps 系統將採用 Drupal 為 CMS

為了要能支援分類研究活動進行,我們的計畫系統在第一年開始時完全是一行一行程式碼寫起來,並且在資料庫層級就分成「學名」、「規約」、「標本」、「文獻」、「人員」及「影像」等數個單元,並分段進行聯結(join)實作,並在第二年期間進行程式碼的最佳化。

隨著一般使用者對網站系統的親和性要求與日俱增,我們了解到,雖然親自針對需要撰寫程式可以造出最合用的輪子,但畢竟無法顧及所有層面,特別是計畫人力不足,而對於使用者及計畫審查者來說,目前很難從程式的內容及寫法給予評價,而多半只能從使用的經驗及資料的筆數來評量計畫的成果。

經過評估,使用 CMS(Content Management System) 除了不用親自撰寫維護許多常用的網站功能外,用了對的 CMS,在客製特殊的需求時(如我們之前為了未來的應用彈性而切分出的許多單元),事半功倍。

目前開放源始碼界最普遍使用的 CMS 主要有 Joomla! 和 Drupal 兩套,前者使用上十分快速,也有炫麗的介面,但不如後者容易客製化及有彈性。就生物多樣性領域而言,歐美地區採用後者的研究單位很多,生命大百科的資訊人員亦提到,若單位沒有人力將網站資料整理成 EOL 可以接受的形式,假使用的是 Drupal,那他們將可以吸收這部分的人力成本,換句話說,用 Drupal 架站就代表著和 EOL 的合作已經滿足了基本的系統條件。

當然合不合作是後面的事,重點是這代表使用 Drupal 可以和許多生物多樣性研究計畫的系統人員有共同的溝通語言,於是我們應該可以得到兩個層面的支援:
  1. Drupal 社群的模組開發經驗;
  2. 生物多樣性資訊在這套系統上的應用經驗。
是故我們已經採用 Drupal 做為新版系統發展使用的 CMS,並且將我們先前整理過的程式碼和功能做成新的模組,應用在管理及使用者經驗的改進上。

我們預定在2009年二月讓新系統上線。

2008年12月15日 星期一

Digileps即將上傳夜蛾總科模式標本圖片

我們將完成黃毒蛾族(Nygmiini), 蕨夜蛾亞科(Eriopinae)的部份, 上傳完成時將於此blog公告.